Hipótesis responde preguntas acerca de si una diferencia observada es estado de salud, riesgo o factores protectores, servicios de salud, o indicadores del sistema de salud son reales o espurias. Hipótesis de una media, proporción o tasa pueden ser probadas comparándolas con una medida estándar.

Asociación observada - la comparación de un sólo estimado y uno estándar, o la comparación de dos o más estimados.

Asociación esperada - la misma comparación pero bajo lo que se llama la hipótesis nula, o la suposición de que no existe asociación.

Asociaciones observadas y las pruebas estadísticas usadas para evaluarlas siguen la conocida como distribución de probabilidad. Valores críticos pueden ser elegidos para evaluar la probabilidad de que la asociación observada es diferente de sus valores esperados. La probabilidad de interpretar una asociación observada es real cuando en efecto es debida al azar, u otra probabilidad de cometer un error tipo 1, es reportado como valor de p.

Por conveniencia, asociaciones son consideradas como significativas cuando el valor de p es <0.05. Cualquier resultado de una prueba estadística basada en la curva Normal estándar la cual es <1.96 medias es menor que el 5% de probabilidad (<0.05), de que las diferencias observadas sean debidas al azar, únicamente. ( O sean probablemente debidas a otras causas, como la intervención, o el factor bajo observación).