В структуре причин младенческой смертности в целом по Кыргызской Республике превалирующее значение имеют болезни органов дыхания, затем идут перинатальные причины, инфекционные и паразитарные заболевания, врожденные аномалии. За прошедшие 10 лет это ранжирование причин не изменилось. Такая ситуация характерна практически для всех регионов, кроме г.Бишкек и Чуйской области, где основной причиной смерти детей являлись и остались к концу десятилетия перинатальные причины, затем врожденные аномалии в г.Бишкек, а в Чуйской области – болезни органов дыхания. Надо отметить, что в Нарынской области впервые в 2000 г. в структуре причин младенческой смертности перинатальные причины заняли лидирующее место.

В течение последних десяти лет в удалось значительно снизить смертность детей от управляемых причин – болезней органов дыхания на 35.5% и инфекционных и паразитарных причин – на 20.0%. Снижению показателя младенческой смертности в республике способствовало также широкое внедрение в республике рекомендаций ВОЗ по грудному вскармливанию. Доля детей, вскармливаемых грудью до шестимесячного возраста увеличилась в последние годы и составляет в среднем по стране 80.4 %.