Вирусный гепатит А имеет широкое распространение на территории всей республики. В многолетней динамике заболеваемости прослеживается периодичность подъёмов с интервалом 2-4 года. Такая же динамика характерна и для других стран ЦАР. В России отмечается тенденция к снижению заболеваемости. Как и другие кишечные инфекции наиболее распространен в южных регионах (Ошская, Жалал-Абадская, Баткенская области), где недостаток доброкачественной питьевой воды в сельских населенных пунктах способствует широкому распространению инфекции. Борьба с вирусным гепатитом А осуществляется в рамках общей стратегии по улучшению обеспечения населения доброкачественной питьевой водой, и повышения санитарной грамотности населения.

Бруцеллез. Заболеваемость бруцеллёзом за последние 10 лет имеет постоянную тенденцию к росту. Основной причиной такой ситуации является неблагополучие в ветеринарном секторе, связанное с распадом крупных животноводческих хозяйств, обеспеченных ветеринарными услугами, и образованием множества мелких крестьянских хозяйств с низкой доступностью ветеринарной помощи. Привлечение детей к уходу за животными в семьях стало причиной роста детского бруцеллёза. Наиболее высокая заболеваемость отмечается в Нарынской, Таласской, Иссык-Кульской областях. Министерством здравоохранения начата разработка программы по контролю бруцеллёза.