Prevalencia de casos son raramente (e.g. en estudios de casos y controles para malformaciones congénitas) incluídos ya que pueden dar lugar a errores debido a su larga duración. 

Su naturaleza de larga latencia le dará margen a que múltiples factores jueguen un papel en la causalidad.

Más aún, los factores que juegan un rol en el pasado lejano, puede causar problemas (falta de certeza con condiciones prevalentes) para la comparación y el análisis.

La dificultad para medir la exposición es otro problema con casos prevalentes.