Внатрешните антигени (M1 и NP протеините) се протеини специфични за типот на вирусот (тип-специфични антигени) што се користат за детерминирање на посебните вируси А, В и С.  Овие протеини имаат вкрстена реактивност .

Екстерните антигени (HA и NA) покажуваат повеќе варијации и се карактеристични за суб-типовите на вирусот. Тие се користат за идентификација на посебните подтипови на грипот тип А и се одговорни за епидемијата. 

Поддтиповите на грипот се именуваат според типот на хемаглутининот и на неуроминидаза протеинските антигени, на пр. како H3N2 за тип 2 хемаглутиназа и тип 3 неуроминидаза површински антигени.

Ако два или повеќе подтипови на грипот инфицираат иста клетка истовремен, нивната протеинска и липидна обвивка се менува и RNA  се транскрибира како mRNA. Клетката домаќин во тој случај формира нов вирус кој ги комбинира антигените. На пр.  H3N2 и H5N1 може да формираат  нов подтип H5N2 вирус.

Бидејќи човековиот имунолошки систем не може да го препознае овој нов подтип, тој може да биде екстремно опасен.