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Las limitaciones de estos estudios provienen de los sesgos de las estadísticas que pueden provocar correlaciones artificiales entre las variables estudiadas. Por otra parte, muchos de estos estudios utilizan estadísticas de consumo diario que no discriminan a nivel individual, ni por sexo , edad, zona geográfica o nivel socioeconómico.. Una solución a este inconveniente sería la realización encuestas individuales A veces puede ocurrir que las correlaciones entre dos variables entre varios grupos pueda ser espúrea, sobre todo cuando las variables independiente y dependiente (exposición y enfermedad, respectivamente estén muy relacionadas con un determinado factor etiológico. Como tanto variable dependiente como independiente se miden a la vez , no puede establecerse una relación secuencial causa-efecto. Una limitación importante de estos análisis en la investigación etiológica es la “falacia ecológica”, consecuencia de realizar inferencias individuales a partir de las observaciones obtenidas de grupos. ((Morgernstem H. Uses of ecologic analysis in epidemiologic research. Am. J. Public Health, 1982; 42:491-496)