飞行带来的长期的健康影响，也是人们关注的另一焦点。例如有人认为，长时间暴露于宇宙射线辐射下或接受机舱里二手烟的熏陶，会加大机组工作人员某些癌症以及白血病的发病机率。不过，人们对于飞行所带来的长期影响，远不如对急性期症状（即DVT）报以的关注大。