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虽然这些假设是使用科学方法的前提，但我们必须紧记诸如安慰剂效应的现象，在这一现象中，人们在接受他们所想的就是治疗之后感觉更好。
同样，自然界中不是所有事物都遵循一个现行的原由并沿轨道起作用。看看龙卷风吧，科学家用模糊逻辑来解释不适用于线性模型的现象。
而且，有时不可能发现发生时间的原由。在这种情况下，技术可以帮忙，正如显微镜帮助解释了作为十九世纪诸多疾病始作俑者的细菌的存在。