肺血管造影存在的一个重要的问题便是它的安全性，在过去的10年间，该问题已经被基本解决了。由于采用了新型的造影剂、更安全的材料和更完善的患者遴选机制，现在严重的并发症已经较罕见了（并且常常与操作过程本身无关）。