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显微镜观察粪便,每个高倍镜视野20个或20个以上的白细胞和红细胞提示为侵袭性腹泻(可能是志贺氏细菌性腹泻)。显微镜观察粪便也可发现寄生虫和肠虫的感染。显微镜暗视野观察可快速诊断弧菌感染。粪便培养可用于检测细菌包括霍乱弧菌,沙门氏菌,志贺氏菌和其他的细菌。酶联免疫吸附试验用于轮状病毒的检测。抗体的检测用于大肠杆菌的不同血清型的鉴定。