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Mientras el estudio cohorte histórico es el mejor conocido tipo de estudio cohorte, hay otros tipos de estudios cohorte.

El estudio cohorte de incidencia evalúa la incidencia de enfermedad y busca identificar los factores de riesgo para el ataque de la enfermedad. Responde la pregunta: "¿es mayor la incidencia en aquellos expuestos que en los no expuestos?".

El estudio cohorte de pronóstico sigue una cohorte enferma para evaluar factores asociados con el resultado. El resultado puede ser recuperación o muerte. El propósito primario es identificar todos los factores explicativos para el resultado. Tales factores explicativos son conocidos como factores pronósticos.

El estudio controlado aleatorizado puede también ser considerado un tipo especial de estudios cohorte.