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Cotinina se ha vuelto un biomarcador popular para la exposición a nicotina debido a que es un metabolito primario de la nicotina, y tiene una vida media más larga que la nicotina. Es muy estable durante el almacenamiento. Sin embargo, amplia variación en el metabolismo de la nicotina entre individuos significa que los niveles de cotinina pueden variar considerablemente, aún entre mujeres que fuman el mismo número de cigarrillos por día..

Cotinina ha sido usada ampliamente en estudios como una medida de exposición al tabaco. Pero las limitaciones de la cotinina no han sido reconocidas.