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La suma total de cuadrados (SS total, siendo SS = Sum of Squares) indica la variabilidad total de la muestra estudiada. De hecho, la varianza es el cociente entre esta SS y la N de la muestra estudiada.

Esta SS total es la suma algebráica de la variabilidad (SS) explicada por los factores considerados en el modelo (efectos principales y sus interacciones) más la variabilidad residual, no explicada por el modelo establecido.

SS = Sum of Squares = Suma de Cuadrados

MS = Mean Squares = Media de Cuadrados